Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Brpf3B2KF05 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Brpf3B2KF05 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Brpf3B2KF05 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Brpf3B2KF05 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Brpf3B2KF05 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Brpf3B2KF05 Gm12592-201ENSMUST00000155332 2954 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Hdhd2-201ENSMUST00000026485 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Fam13c-203ENSMUST00000173042 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Atg9a-201ENSMUST00000040689 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Gm11100-201ENSMUST00000112652 1951 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 D030018L15Rik-203ENSMUST00000140253 2902 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Gm35394-201ENSMUST00000196434 3252 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Rnf121-201ENSMUST00000089052 2344 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 2900060N12Rik-201ENSMUST00000221412 3721 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Ctsa-201ENSMUST00000017904 3674 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Mbnl1-203ENSMUST00000191747 4046 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Dido1-205ENSMUST00000103056 4281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Gm10390-202ENSMUST00000181905 4269 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Samsn1-201ENSMUST00000114239 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Gm14372-201ENSMUST00000125355 2193 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Zcchc8-201ENSMUST00000031376 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Il7-204ENSMUST00000194184 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Unc13d-209ENSMUST00000174822 3337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Rffl-204ENSMUST00000093975 3575 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Brpf3B2KF05 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms