Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm12664-201ENSMUST00000118306 913 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm2541-201ENSMUST00000161209 711 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm5885-202ENSMUST00000203357 528 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Olfr987-201ENSMUST00000099929 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Olfr749-202ENSMUST00000214290 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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