Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Gm15482-201ENSMUST00000152691 4529 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Ogdh-204ENSMUST00000101554 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Phc1-215ENSMUST00000161739 3893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Sh2d7-201ENSMUST00000060242 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Tnc-204ENSMUST00000107377 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Nop56Q9D6Z1 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Nop56Q9D6Z1 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 5830462I19Rik-201ENSMUST00000168137 3383 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Zfp532-201ENSMUST00000049016 5503 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Tmem63a-205ENSMUST00000161523 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Cbfa2t2-201ENSMUST00000045270 6069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm35715-201ENSMUST00000197421 2054 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Frmpd1-201ENSMUST00000044773 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Dhdh-201ENSMUST00000011526 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Dock4-204ENSMUST00000220912 7360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Nop56Q9D6Z1 Gm30132-201ENSMUST00000212816 8757 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Nop56Q9D6Z1 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Nop56Q9D6Z1 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Sall4-203ENSMUST00000103074 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Atp8b3-201ENSMUST00000020383 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm4784-201ENSMUST00000117365 1824 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm15612-201ENSMUST00000147542 3118 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Aplp2-201ENSMUST00000072634 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Sppl2c-202ENSMUST00000107000 2225 ntAPPRIS P4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Carhsp1-201ENSMUST00000008537 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm28138-201ENSMUST00000186250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm29270-201ENSMUST00000188071 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm29392-201ENSMUST00000189429 2167 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm29252-201ENSMUST00000189869 2167 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm29305-201ENSMUST00000191054 2167 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm45635-201ENSMUST00000211516 2134 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Tcn2-202ENSMUST00000109988 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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