Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 AC116596.1-201ENSMUST00000228112 1762 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Lyrm1-204ENSMUST00000106518 875 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Wfdc2-203ENSMUST00000109345 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm13547-202ENSMUST00000113810 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm14145-201ENSMUST00000133385 508 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm14146-201ENSMUST00000155885 508 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm3945-201ENSMUST00000196637 683 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm33969-201ENSMUST00000197615 388 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm23458-201ENSMUST00000083257 169 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Rplp1-ps1-201ENSMUST00000119410 345 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm3898-201ENSMUST00000180221 613 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm43450-201ENSMUST00000202611 632 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Scgb3a1-201ENSMUST00000043873 493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm9869-201ENSMUST00000063858 375 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Scgb3a1-202ENSMUST00000076006 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Cd247-202ENSMUST00000027849 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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