Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 9230114K14Rik-202ENSMUST00000198720 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 AC149294.3-201ENSMUST00000226888 732 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm9531-201ENSMUST00000055820 638 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U6N9 A1cf-204ENSMUST00000224564 1432 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Q3U6N9 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Q3U6N9 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U6N9 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Q3U6N9 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Q3U6N9 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Q3U6N9 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Q3U6N9 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Q3U6N9 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Q3U6N9 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Q3U6N9 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U6N9 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Slc10a4-202ENSMUST00000201304 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 1700048O20Rik-202ENSMUST00000214777 1900 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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