Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm44017-201ENSMUST00000203231 740 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm8991-201ENSMUST00000073014 1075 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Acvr1-203ENSMUST00000112599 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Harbi1-201ENSMUST00000090608 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Pax5-202ENSMUST00000102932 1460 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Ighv8-6-201ENSMUST00000103524 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Masp2-202ENSMUST00000105701 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm15602-201ENSMUST00000116162 465 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm23999-201ENSMUST00000158057 104 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm16574-201ENSMUST00000159301 745 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm16581-201ENSMUST00000160730 991 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Pttg1ip-208ENSMUST00000162943 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm7583-201ENSMUST00000182941 1005 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Slc10a4-202ENSMUST00000201304 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm33570-201ENSMUST00000207608 1254 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 CT025689.5-201ENSMUST00000224316 986 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gpatch1-201ENSMUST00000079693 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm5099-201ENSMUST00000194892 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Babam2-201ENSMUST00000063813 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm11771-201ENSMUST00000118124 732 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm1758-201ENSMUST00000164528 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm6773-201ENSMUST00000182377 878 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Mir6360-201ENSMUST00000184278 126 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm31466-201ENSMUST00000195457 916 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Xlr4b-201ENSMUST00000069077 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms