Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Phf20-201ENSMUST00000037401 5737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Fbxo38-201ENSMUST00000048688 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Rp1l1-201ENSMUST00000058229 6684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Lrba-204ENSMUST00000194759 9379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Igf2bp1-201ENSMUST00000013559 8378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms