Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Gm24368-201ENSMUST00000175388 106 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Gm20821-202ENSMUST00000180352 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Gm18443-201ENSMUST00000185358 556 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 1810018F18Rik-201ENSMUST00000188253 277 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Gm44709-201ENSMUST00000207649 448 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Hdac9-208ENSMUST00000211107 1683 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Gm31763-202ENSMUST00000218205 1724 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Gm24471-201ENSMUST00000104485 131 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Klk13-201ENSMUST00000066834 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Gm16033-201ENSMUST00000144915 596 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Btn2a2-204ENSMUST00000223877 2109 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc13P50207 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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