Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Olfr484-202ENSMUST00000214722 4676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Htr5a-201ENSMUST00000036227 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Tec-201ENSMUST00000071944 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Diaph1-201ENSMUST00000025337 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm14372-201ENSMUST00000125355 2193 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Aplp2-201ENSMUST00000072634 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Tnk2-206ENSMUST00000115125 4313 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Enah-211ENSMUST00000193703 11229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Atg13-202ENSMUST00000076803 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Zfp958-202ENSMUST00000202692 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm45889-202ENSMUST00000211255 2358 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Fblim1-203ENSMUST00000105785 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Tns1-208ENSMUST00000187584 9916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gsdmc3-203ENSMUST00000190682 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Mgme1-201ENSMUST00000028910 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Glyctk-201ENSMUST00000036382 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm9271-201ENSMUST00000185988 2580 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Dram2-202ENSMUST00000067630 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Lpin1-201ENSMUST00000067124 5581 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Zmiz2-204ENSMUST00000109786 4319 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Fam217a-202ENSMUST00000223834 2253 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Slc18a2-201ENSMUST00000026084 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Olfr1199-204ENSMUST00000213138 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Ctnnd1-218ENSMUST00000111692 6170 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Tiam1-201ENSMUST00000002588 7290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Odf2-205ENSMUST00000113757 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 D3Ertd751e-201ENSMUST00000026867 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Mapkap1-203ENSMUST00000113126 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Mthfd1-206ENSMUST00000220046 3040 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Tacr1-202ENSMUST00000203775 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Plscr2-205ENSMUST00000180154 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Recql5os1-201ENSMUST00000134391 396 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Kcnj5-202ENSMUST00000214223 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms