Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dnmt3cP0DOY1 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dnmt3cP0DOY1 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dnmt3cP0DOY1 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Dnmt3cP0DOY1 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dnmt3cP0DOY1 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Dnmt3cP0DOY1 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dnmt3cP0DOY1 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dnmt3cP0DOY1 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dnmt3cP0DOY1 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dnmt3cP0DOY1 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dnmt3cP0DOY1 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dnmt3cP0DOY1 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dnmt3cP0DOY1 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dnmt3cP0DOY1 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dnmt3cP0DOY1 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dnmt3cP0DOY1 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dnmt3cP0DOY1 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dnmt3cP0DOY1 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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