Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm17799-201ENSMUST00000183270 667 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm9409-201ENSMUST00000197017 316 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Fut1-202ENSMUST00000209379 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm12207-201ENSMUST00000143016 494 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm37009-201ENSMUST00000193297 361 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms