Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Ppip5k1-201ENSMUST00000052029 5533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Gm37464-201ENSMUST00000192431 2220 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Cdadc1-202ENSMUST00000056997 2202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Cpne5-201ENSMUST00000024805 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Pcdhb11-201ENSMUST00000053073 4419 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Nt5c1b-203ENSMUST00000143739 1570 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Fam149b-210ENSMUST00000224721 4483 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Helb-201ENSMUST00000020449 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Lnpk-203ENSMUST00000111993 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Scml2-202ENSMUST00000074802 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Inpp4b-212ENSMUST00000215332 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Pcx-204ENSMUST00000224726 4034 ntAPPRIS P3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Catsperd-201ENSMUST00000112979 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Atg14-201ENSMUST00000042988 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Myh4-202ENSMUST00000170942 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Cdca2-205ENSMUST00000150006 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Wdfy4-202ENSMUST00000130509 10158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Ptprb-201ENSMUST00000092167 11911 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Tdrd1-203ENSMUST00000111606 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Odf2-210ENSMUST00000113765 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Acvr1-203ENSMUST00000112599 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Gm37039-201ENSMUST00000193733 2485 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Pde4d-202ENSMUST00000079975 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 A230056P14Rik-201ENSMUST00000130189 2177 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 AC153940.1-201ENSMUST00000220149 5300 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 AC116589.5-201ENSMUST00000222230 1660 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Prdx3-201ENSMUST00000025961 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Hmgb4-201ENSMUST00000053830 746 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Fam53b-206ENSMUST00000106168 3630 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Hcfc1-201ENSMUST00000033761 8138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Gm15663-201ENSMUST00000145794 3200 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 BC024978-201ENSMUST00000108379 7247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Prc1-201ENSMUST00000047558 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Hivep3-209ENSMUST00000166542 7253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Cgnl1-201ENSMUST00000072899 6754 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Kif23-201ENSMUST00000034815 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Kdm4a-201ENSMUST00000050288 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Mia3-202ENSMUST00000109158 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Mis18bp1-201ENSMUST00000052201 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Kif28-203ENSMUST00000221136 3538 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Gm13498-201ENSMUST00000119159 2166 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Pfkm-202ENSMUST00000163507 2816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Mfap3l-201ENSMUST00000034066 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Synrg-202ENSMUST00000092834 7115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 BC030343-201ENSMUST00000199606 2439 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Sptbn1-201ENSMUST00000006629 8461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 C1ra-201ENSMUST00000068593 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms