Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Rnf169E9Q7F2 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rnf169E9Q7F2 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rnf169E9Q7F2 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms