Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrit3W8DXL4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrit3W8DXL4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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