Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sumo3Q9Z172 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sumo3Q9Z172 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sumo3Q9Z172 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sumo3Q9Z172 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sumo3Q9Z172 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sumo3Q9Z172 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sumo3Q9Z172 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sumo3Q9Z172 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sumo3Q9Z172 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sumo3Q9Z172 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sumo3Q9Z172 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sumo3Q9Z172 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sumo3Q9Z172 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sumo3Q9Z172 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sumo3Q9Z172 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sumo3Q9Z172 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sumo3Q9Z172 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sumo3Q9Z172 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sumo3Q9Z172 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sumo3Q9Z172 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sumo3Q9Z172 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sumo3Q9Z172 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sumo3Q9Z172 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sumo3Q9Z172 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sumo3Q9Z172 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sumo3Q9Z172 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sumo3Q9Z172 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sumo3Q9Z172 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sumo3Q9Z172 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sumo3Q9Z172 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sumo3Q9Z172 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sumo3Q9Z172 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms