Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F6

Rad9a, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad9aQ9Z0F6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad9aQ9Z0F6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad9aQ9Z0F6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad9aQ9Z0F6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad9aQ9Z0F6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms