Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gbp2Q9Z0E6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gbp2Q9Z0E6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gbp2Q9Z0E6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gbp2Q9Z0E6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gbp2Q9Z0E6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gbp2Q9Z0E6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gbp2Q9Z0E6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gbp2Q9Z0E6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gbp2Q9Z0E6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gbp2Q9Z0E6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gbp2Q9Z0E6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gbp2Q9Z0E6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gbp2Q9Z0E6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gbp2Q9Z0E6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gbp2Q9Z0E6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gbp2Q9Z0E6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gbp2Q9Z0E6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gbp2Q9Z0E6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gbp2Q9Z0E6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gbp2Q9Z0E6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gbp2Q9Z0E6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gbp2Q9Z0E6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gbp2Q9Z0E6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gbp2Q9Z0E6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbp2Q9Z0E6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms