Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VapaQ9WV55 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VapaQ9WV55 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VapaQ9WV55 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VapaQ9WV55 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VapaQ9WV55 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VapaQ9WV55 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VapaQ9WV55 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VapaQ9WV55 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VapaQ9WV55 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VapaQ9WV55 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VapaQ9WV55 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VapaQ9WV55 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VapaQ9WV55 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VapaQ9WV55 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
VapaQ9WV55 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VapaQ9WV55 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VapaQ9WV55 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VapaQ9WV55 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VapaQ9WV55 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VapaQ9WV55 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VapaQ9WV55 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VapaQ9WV55 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VapaQ9WV55 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VapaQ9WV55 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VapaQ9WV55 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VapaQ9WV55 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VapaQ9WV55 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VapaQ9WV55 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VapaQ9WV55 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VapaQ9WV55 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VapaQ9WV55 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VapaQ9WV55 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VapaQ9WV55 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VapaQ9WV55 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VapaQ9WV55 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VapaQ9WV55 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VapaQ9WV55 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms