Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms