Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfsf13bQ9WU72 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfsf13bQ9WU72 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms