Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nfe2l3Q9WTM4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Nfe2l3Q9WTM4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nfe2l3Q9WTM4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nfe2l3Q9WTM4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nfe2l3Q9WTM4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nfe2l3Q9WTM4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nfe2l3Q9WTM4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nfe2l3Q9WTM4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nfe2l3Q9WTM4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nfe2l3Q9WTM4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nfe2l3Q9WTM4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nfe2l3Q9WTM4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nfe2l3Q9WTM4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nfe2l3Q9WTM4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nfe2l3Q9WTM4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nfe2l3Q9WTM4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nfe2l3Q9WTM4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nfe2l3Q9WTM4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nfe2l3Q9WTM4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nfe2l3Q9WTM4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nfe2l3Q9WTM4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nfe2l3Q9WTM4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nfe2l3Q9WTM4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nfe2l3Q9WTM4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nfe2l3Q9WTM4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nfe2l3Q9WTM4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nfe2l3Q9WTM4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nfe2l3Q9WTM4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nfe2l3Q9WTM4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nfe2l3Q9WTM4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nfe2l3Q9WTM4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nfe2l3Q9WTM4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nfe2l3Q9WTM4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nfe2l3Q9WTM4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nfe2l3Q9WTM4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nfe2l3Q9WTM4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nfe2l3Q9WTM4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nfe2l3Q9WTM4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nfe2l3Q9WTM4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nfe2l3Q9WTM4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nfe2l3Q9WTM4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nfe2l3Q9WTM4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nfe2l3Q9WTM4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nfe2l3Q9WTM4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Nfe2l3Q9WTM4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nfe2l3Q9WTM4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Nfe2l3Q9WTM4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nfe2l3Q9WTM4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nfe2l3Q9WTM4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nfe2l3Q9WTM4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nfe2l3Q9WTM4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nfe2l3Q9WTM4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nfe2l3Q9WTM4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nfe2l3Q9WTM4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Nfe2l3Q9WTM4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Nfe2l3Q9WTM4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nfe2l3Q9WTM4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nfe2l3Q9WTM4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nfe2l3Q9WTM4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nfe2l3Q9WTM4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms