Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prg3Q9JL95 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prg3Q9JL95 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prg3Q9JL95 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.8 ms