Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Nova1Q9JKN6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.8 ms