Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ybx3Q9JKB3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ybx3Q9JKB3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ybx3Q9JKB3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ybx3Q9JKB3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms