Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ascl3Q9JJR7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ascl3Q9JJR7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ascl3Q9JJR7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ascl3Q9JJR7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ascl3Q9JJR7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ascl3Q9JJR7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ascl3Q9JJR7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ascl3Q9JJR7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ascl3Q9JJR7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ascl3Q9JJR7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ascl3Q9JJR7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms