Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ28

Flii, Protein flightless-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FliiQ9JJ28 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FliiQ9JJ28 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
FliiQ9JJ28 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms