Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ercc6l2Q9JIM3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ercc6l2Q9JIM3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ercc6l2Q9JIM3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ercc6l2Q9JIM3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Ercc6l2Q9JIM3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ercc6l2Q9JIM3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ercc6l2Q9JIM3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ercc6l2Q9JIM3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ercc6l2Q9JIM3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ercc6l2Q9JIM3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ercc6l2Q9JIM3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ercc6l2Q9JIM3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ercc6l2Q9JIM3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ercc6l2Q9JIM3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ercc6l2Q9JIM3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ercc6l2Q9JIM3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ercc6l2Q9JIM3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ercc6l2Q9JIM3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ercc6l2Q9JIM3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Ercc6l2Q9JIM3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ercc6l2Q9JIM3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ercc6l2Q9JIM3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ercc6l2Q9JIM3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ercc6l2Q9JIM3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ercc6l2Q9JIM3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ercc6l2Q9JIM3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ercc6l2Q9JIM3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ercc6l2Q9JIM3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ercc6l2Q9JIM3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ercc6l2Q9JIM3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ercc6l2Q9JIM3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ercc6l2Q9JIM3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ercc6l2Q9JIM3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ercc6l2Q9JIM3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ercc6l2Q9JIM3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ercc6l2Q9JIM3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ercc6l2Q9JIM3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ercc6l2Q9JIM3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ercc6l2Q9JIM3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ercc6l2Q9JIM3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ercc6l2Q9JIM3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ercc6l2Q9JIM3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ercc6l2Q9JIM3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ercc6l2Q9JIM3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ercc6l2Q9JIM3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Ercc6l2Q9JIM3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ercc6l2Q9JIM3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ercc6l2Q9JIM3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ercc6l2Q9JIM3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ercc6l2Q9JIM3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ercc6l2Q9JIM3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ercc6l2Q9JIM3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ercc6l2Q9JIM3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ercc6l2Q9JIM3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ercc6l2Q9JIM3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ercc6l2Q9JIM3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ercc6l2Q9JIM3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ercc6l2Q9JIM3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ercc6l2Q9JIM3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ercc6l2Q9JIM3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms