Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RabggtaQ9JHK4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RabggtaQ9JHK4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms