Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zcchc17Q9ESX4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zcchc17Q9ESX4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms