Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQJ0

Tpcn1, Two pore calcium channel protein 1, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpcn1Q9EQJ0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Tpcn1Q9EQJ0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Tpcn1Q9EQJ0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Tpcn1Q9EQJ0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Tpcn1Q9EQJ0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Tpcn1Q9EQJ0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpcn1Q9EQJ0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Tpcn1Q9EQJ0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpcn1Q9EQJ0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpcn1Q9EQJ0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Tpcn1Q9EQJ0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Tpcn1Q9EQJ0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpcn1Q9EQJ0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Tpcn1Q9EQJ0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpcn1Q9EQJ0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpcn1Q9EQJ0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Tpcn1Q9EQJ0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Tpcn1Q9EQJ0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Tpcn1Q9EQJ0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpcn1Q9EQJ0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpcn1Q9EQJ0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpcn1Q9EQJ0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpcn1Q9EQJ0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tpcn1Q9EQJ0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tpcn1Q9EQJ0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Tpcn1Q9EQJ0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tpcn1Q9EQJ0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tpcn1Q9EQJ0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpcn1Q9EQJ0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpcn1Q9EQJ0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpcn1Q9EQJ0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpcn1Q9EQJ0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpcn1Q9EQJ0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpcn1Q9EQJ0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpcn1Q9EQJ0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpcn1Q9EQJ0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpcn1Q9EQJ0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms