Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Vmn1r44Q9EQ47 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Vmn1r44Q9EQ47 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Vmn1r44Q9EQ47 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Vmn1r44Q9EQ47 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r44Q9EQ47 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r44Q9EQ47 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r44Q9EQ47 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Vmn1r44Q9EQ47 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Vmn1r44Q9EQ47 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Vmn1r44Q9EQ47 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Vmn1r44Q9EQ47 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Vmn1r44Q9EQ47 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Vmn1r44Q9EQ47 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Vmn1r44Q9EQ47 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Vmn1r44Q9EQ47 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Vmn1r44Q9EQ47 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Vmn1r44Q9EQ47 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Vmn1r44Q9EQ47 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Vmn1r44Q9EQ47 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r44Q9EQ47 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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