Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9DA42 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9DA42 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9DA42 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9DA42 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9DA42 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9DA42 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9DA42 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9DA42 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9DA42 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9DA42 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9DA42 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9DA42 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9DA42 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9DA42 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9DA42 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Q9DA42 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Q9DA42 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Q9DA42 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9DA42 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9DA42 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9DA42 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9DA42 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9DA42 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9DA42 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9DA42 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9DA42 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9DA42 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9DA42 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9DA42 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9DA42 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9DA42 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9DA42 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9DA42 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9DA42 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9DA42 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9DA42 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9DA42 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9DA42 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9DA42 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9DA42 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9DA42 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9DA42 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9DA42 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9DA42 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9DA42 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9DA42 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9DA42 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9DA42 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9DA42 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9DA42 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9DA42 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q9DA42 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q9DA42 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q9DA42 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q9DA42 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q9DA42 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q9DA42 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q9DA42 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q9DA42 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q9DA42 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q9DA42 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q9DA42 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q9DA42 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Q9DA42 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Q9DA42 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Q9DA42 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Q9DA42 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Q9DA42 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Q9DA42 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Q9DA42 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Q9DA42 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Q9DA42 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Q9DA42 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Q9DA42 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Q9DA42 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Q9DA42 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Q9DA42 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Q9DA42 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Q9DA42 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Q9DA42 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Q9DA42 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Q9DA42 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Q9DA42 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Q9DA42 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Q9DA42 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Q9DA42 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Q9DA42 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Q9DA42 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Q9DA42 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Q9DA42 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Q9DA42 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Q9DA42 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Q9DA42 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Q9DA42 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Q9DA42 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Q9DA42 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Q9DA42 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Q9DA42 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Q9DA42 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms