Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smco2Q9DA21 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms