Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C6

Med11, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med11Q9D8C6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med11Q9D8C6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms