Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn22Q9D7U6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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