Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MsraQ9D6Y7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MsraQ9D6Y7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MsraQ9D6Y7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MsraQ9D6Y7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MsraQ9D6Y7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MsraQ9D6Y7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MsraQ9D6Y7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MsraQ9D6Y7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MsraQ9D6Y7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MsraQ9D6Y7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MsraQ9D6Y7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MsraQ9D6Y7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MsraQ9D6Y7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MsraQ9D6Y7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MsraQ9D6Y7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MsraQ9D6Y7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MsraQ9D6Y7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MsraQ9D6Y7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms