Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V4

Taf1d, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1dQ9D4V4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Taf1dQ9D4V4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Taf1dQ9D4V4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Taf1dQ9D4V4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Taf1dQ9D4V4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Taf1dQ9D4V4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Taf1dQ9D4V4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Taf1dQ9D4V4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Taf1dQ9D4V4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Taf1dQ9D4V4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms