Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Gcc1Q9D4H2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gcc1Q9D4H2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gcc1Q9D4H2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms