Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clvs1Q9D4C9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms