Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R3

Cep72, Centrosomal protein of 72 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep72Q9D3R3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep72Q9D3R3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep72Q9D3R3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep72Q9D3R3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep72Q9D3R3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep72Q9D3R3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cep72Q9D3R3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cep72Q9D3R3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cep72Q9D3R3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cep72Q9D3R3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cep72Q9D3R3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cep72Q9D3R3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cep72Q9D3R3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cep72Q9D3R3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cep72Q9D3R3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cep72Q9D3R3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cep72Q9D3R3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cep72Q9D3R3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep72Q9D3R3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep72Q9D3R3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep72Q9D3R3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep72Q9D3R3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep72Q9D3R3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep72Q9D3R3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep72Q9D3R3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep72Q9D3R3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep72Q9D3R3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep72Q9D3R3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep72Q9D3R3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep72Q9D3R3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep72Q9D3R3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep72Q9D3R3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep72Q9D3R3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep72Q9D3R3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep72Q9D3R3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep72Q9D3R3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep72Q9D3R3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep72Q9D3R3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep72Q9D3R3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep72Q9D3R3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep72Q9D3R3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep72Q9D3R3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep72Q9D3R3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep72Q9D3R3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep72Q9D3R3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep72Q9D3R3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep72Q9D3R3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep72Q9D3R3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep72Q9D3R3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep72Q9D3R3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms