Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D6

Cthrc1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cthrc1Q9D1D6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cthrc1Q9D1D6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms