Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Sycp2Q9CUU3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Sycp2Q9CUU3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Sycp2Q9CUU3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Sycp2Q9CUU3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
Sycp2Q9CUU3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Sycp2Q9CUU3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Sycp2Q9CUU3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Sycp2Q9CUU3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Sycp2Q9CUU3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Sycp2Q9CUU3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
Sycp2Q9CUU3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Sycp2Q9CUU3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Sycp2Q9CUU3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Sycp2Q9CUU3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Sycp2Q9CUU3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Sycp2Q9CUU3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Sycp2Q9CUU3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Sycp2Q9CUU3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
Sycp2Q9CUU3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Sycp2Q9CUU3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Sycp2Q9CUU3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
Sycp2Q9CUU3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Sycp2Q9CUU3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Sycp2Q9CUU3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Sycp2Q9CUU3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Sycp2Q9CUU3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Sycp2Q9CUU3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Sycp2Q9CUU3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Sycp2Q9CUU3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC37.32■■■■□ 3.57
Sycp2Q9CUU3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Sycp2Q9CUU3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
Sycp2Q9CUU3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Sycp2Q9CUU3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Sycp2Q9CUU3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Sycp2Q9CUU3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Sycp2Q9CUU3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Sycp2Q9CUU3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Sycp2Q9CUU3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Sycp2Q9CUU3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Sycp2Q9CUU3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Sycp2Q9CUU3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Sycp2Q9CUU3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Sycp2Q9CUU3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
Sycp2Q9CUU3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Sycp2Q9CUU3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Sycp2Q9CUU3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Sycp2Q9CUU3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Sycp2Q9CUU3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Sycp2Q9CUU3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Sycp2Q9CUU3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Sycp2Q9CUU3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Sycp2Q9CUU3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Sycp2Q9CUU3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Sycp2Q9CUU3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Sycp2Q9CUU3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Sycp2Q9CUU3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Sycp2Q9CUU3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Sycp2Q9CUU3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Sycp2Q9CUU3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Sycp2Q9CUU3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Sycp2Q9CUU3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Sycp2Q9CUU3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.55
Sycp2Q9CUU3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Sycp2Q9CUU3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
Sycp2Q9CUU3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Sycp2Q9CUU3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Sycp2Q9CUU3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Sycp2Q9CUU3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Sycp2Q9CUU3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Sycp2Q9CUU3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Sycp2Q9CUU3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Sycp2Q9CUU3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Sycp2Q9CUU3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Sycp2Q9CUU3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
Sycp2Q9CUU3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Sycp2Q9CUU3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Sycp2Q9CUU3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Sycp2Q9CUU3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Sycp2Q9CUU3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Sycp2Q9CUU3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Sycp2Q9CUU3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Sycp2Q9CUU3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Sycp2Q9CUU3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Sycp2Q9CUU3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Sycp2Q9CUU3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
Sycp2Q9CUU3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Sycp2Q9CUU3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Sycp2Q9CUU3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Sycp2Q9CUU3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
Sycp2Q9CUU3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
Sycp2Q9CUU3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Sycp2Q9CUU3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Sycp2Q9CUU3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Sycp2Q9CUU3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Sycp2Q9CUU3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Sycp2Q9CUU3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Sycp2Q9CUU3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Sycp2Q9CUU3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
Sycp2Q9CUU3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms