Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms