Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nudt21Q9CQF3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nudt21Q9CQF3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms