Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2a1Q99PM3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms