Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl43Q99N89 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl43Q99N89 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl43Q99N89 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl43Q99N89 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl43Q99N89 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl43Q99N89 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl43Q99N89 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl43Q99N89 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl43Q99N89 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl43Q99N89 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl43Q99N89 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl43Q99N89 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl43Q99N89 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl43Q99N89 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl43Q99N89 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl43Q99N89 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl43Q99N89 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl43Q99N89 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl43Q99N89 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl43Q99N89 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl43Q99N89 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl43Q99N89 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl43Q99N89 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl43Q99N89 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl43Q99N89 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl43Q99N89 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl43Q99N89 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl43Q99N89 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl43Q99N89 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl43Q99N89 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl43Q99N89 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl43Q99N89 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl43Q99N89 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl43Q99N89 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl43Q99N89 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl43Q99N89 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Mrpl43Q99N89 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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