Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms