Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp16Q99LG0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms