Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clint1Q99KN9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clint1Q99KN9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms