Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms